A l'origine, prieuré fondé par l'abbaye bénédictine de Saint-Dalmas-de-Pedona au Piémont.
Les templiers qui administraient le sanctuaire de Fenestre y furent arrêtés en 1307, ce qui apparut comme un maléfice et donna lieu à de nombreuses légendes.
Ce n’est qu’en 1860 que le village est annexé à la France par le vote unanime de la population pour approuver le transfert d’autorité entre le Roi de Sardaigne Victor Emmanuel II et l'Empereur des Français Napoléon III.

C’est alors que le village de Saint Martin devint un lieu privilégié de villégiature des aristocrates italiens, anglais et des notables niçois. La « Suisse Niçoise » était née.