Depuis 1958 la Citadelle tropézienne contient le musée Naval. Il est équipé d’une douzaine de salles consistant à redécouvrir le patrimoine naval allant de l’Antiquité jusqu’à une période plus contemporaine. Ces salles exposées en permanence au public, montre des matériaux archéologiques sous-marins, des maquettes, des gravures, des peintures et documents témoignant du chemin d’hommes célèbres de la ville. Deux salles sont réservées à Pierre André (bailli du roi) et à Jean François Allard lui-même officier napoléonien devenu généralissime d’un Prince Indien.
Le débarquement allié de la 2nde Guerre Mondiale est également traité, entre autres, à travers de surprenantes cartes d’état major retraçant un historique de la progression des libérateurs sur les côtes.
La terrasse supérieure du musée offre un panorama exceptionnel aux curieux venus apprécier les différents objets de navigation les plongeant alors dans un historique maritime passionnant.