L'implantation humaine à Isola remonte à l'époque pré-romaine, son nom provient du ligure leudola signifiant « pente herbeuse ».

En 1702, les habitants du village rachètent leurs droits, Isola devenant ainsi une commune libre. Sa population s'élève alors à 1 080 habitants qui tirent leur subsistance de l'élevage et des châtaigneraies.

En 1860, comme partie du comté de Nice, le village rejoint la France.